Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SbdsP70122 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms