Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms