Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps18P62270 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps18P62270 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms