Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnnP61807 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnnP61807 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnnP61807 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnnP61807 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnnP61807 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms