Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga11P61622 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms