Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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