Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms