Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lad1P57016 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lad1P57016 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lad1P57016 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms