Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bace1P56818 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms