Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmoP56726 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmoP56726 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmoP56726 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmoP56726 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmoP56726 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmoP56726 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmoP56726 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmoP56726 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmoP56726 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmoP56726 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms