Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd38P56528 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms