Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp5P56399 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp5P56399 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms