Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GemP55041 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GemP55041 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GemP55041 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GemP55041 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GemP55041 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GemP55041 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms