Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PctpP53808 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PctpP53808 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PctpP53808 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PctpP53808 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms