Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DbtP53395 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DbtP53395 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DbtP53395 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DbtP53395 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms