Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Map3k1P53349 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Map3k1P53349 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Map3k1P53349 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Map3k1P53349 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms