Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms