Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RoraP51448 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RoraP51448 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms