Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc13P50207 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc13P50207 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms