Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hnrnpa1P49312 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms