Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb42P49222 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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