Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LmnaP48678 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LmnaP48678 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LmnaP48678 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms