Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms