Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gli1P47806 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gli1P47806 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms