Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-2P42586 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-2P42586 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms