Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThpoP40226 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms