Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms