Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
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Chd1P40201 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd1P40201 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd1P40201 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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