Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms