Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pola1P33609 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms