Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms