Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm4P32211 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms