Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch4P31695 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms