Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnd1P30999 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms