Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms