Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl3P27659 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms