Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
U2af2P26369 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
U2af2P26369 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
U2af2P26369 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
U2af2P26369 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms