Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CftrP26361 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CftrP26361 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CftrP26361 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CftrP26361 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CftrP26361 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CftrP26361 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CftrP26361 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CftrP26361 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms