Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnna1P26231 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms