Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk11bP24788 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms