Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsta3P23591 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsta3P23591 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms