Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PparaP23204 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms