Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RarbP22605 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RarbP22605 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RarbP22605 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RarbP22605 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RarbP22605 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RarbP22605 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RarbP22605 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RarbP22605 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms