Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tap1P21958 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tap1P21958 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms