Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BdnfP21237 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms