Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F3P20352 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F3P20352 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
F3P20352 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
F3P20352 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F3P20352 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F3P20352 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
F3P20352 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F3P20352 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F3P20352 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F3P20352 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
F3P20352 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms