Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P20040 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P20040 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P20040 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms