Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox5bP19536 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms