Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka1P18653 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms