Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms